时空组学经典论文阅读 Spatiotemporal single-cell analysis decodes cellular dynamics underlying different responses to immunotherapy in colorectal cancer

Spatiotemporal single-cell analysis decodes cellular dynamics underlying different responses to immunotherapy in colorectal cancer

---

Author:: Yuqing Chen, Dongfang Wang, Yingjie Li, Lu Qi, Wen Si, Yufei Bo, Xueyan Chen, Zhaochen Ye, Hongtao Fan, Baolin Liu, Chang Liu, Li Zhang, Xiaoyan Zhang, Zhongwu Li, Linna Zhu, Aiwen Wu, Zemin Zhang

Citation: [[_EXTRA/_paper/@Spatiotemporal single-cell analysis decodes cellular dynamics underlying different responses to immunotherapy in colorectal cancer]]

---

Abstract

Expanding the efficacy of immune checkpoint blockade (ICB) in colorectal cancer (CRC) presses for a comprehensive understanding of treatment responsiveness. Here, we analyze multiple sequential single-cell samples from 22 patients undergoing PD-1 blockade to map the evolution of local and systemic immunity of CRC patients. In tumors, we identify coordinated cellular programs exhibiting distinct response associations. Specifically, exhausted T (Tex) or tumor-reactive-like CD8⁺ T (Ttr-like) cells are closely related to treatment efficacy, and Tex cells show correlated proportion changes with multiple other tumor-enriched cell types following PD-1 blockade. In addition, we reveal the less-exhausted phenotype of blood-associated Ttr-like cells in tumors and find that their higher abundance suggests better treatment outcomes. Finally, a higher major histocompatibility complex (MHC) II-related signature in circulating CD8⁺ T cells at baseline is linked to superior responses. Our study provides insights into the spatiotemporal cellular dynamics following neoadjuvant PD-1 blockade in CRC.

扩大免疫检查点阻断 (ICB) 在结直肠癌 (CRC) 中的疗效迫切需要全面了解治疗反应性。在这里，我们分析了 22 名接受 PD-1 阻断的患者的多个连续单细胞样本，以绘制 CRC 患者局部和全身免疫的演变。在肿瘤中，我们确定了表现出不同反应关联的协调细胞程序。具体而言，耗竭 T (Tex) 或肿瘤反应样 CD8 + T (Ttr 样) 细胞与治疗效果密切相关，并且 Tex 细胞在 PD-1 阻断后与多种其他肿瘤富集细胞类型显示出相关的比例变化。此外，我们揭示了肿瘤中血液相关 Ttr 样细胞的耗竭程度较低的表型，并发现它们的丰度越高表明治疗效果越好。最后，基线时循环 CD8 + T 细胞中较高的主要组织相容性复合体 (MHC) II 相关特征与更好的反应有关。我们的研究为 CRC 新辅助 PD-1 阻断后的时空细胞动态提供了见解。

[!note]

• 免疫检查点阻断（ICB，Immune Checkpoint Blockade）：一种免疫疗法，通过阻断免疫检查点分子（如PD-1、PD-L1等）来增强免疫系统对癌细胞的攻击，从而提高治疗效果。

• 结直肠癌（CRC，Colorectal Cancer）：指结肠或直肠的恶性肿瘤，是常见的消化道癌症之一。

• PD-1阻断：一种免疫检查点抑制剂治疗方法，通过阻断PD-1蛋白，解除其对免疫细胞的抑制，从而增强免疫系统的抗癌作用。

• 单细胞样本：从单个细胞中提取的样本，用于分析个体细胞的特性和变化，提供更精细的生物学信息。

• 局部和系统免疫：局部免疫指特定器官或区域的免疫反应，系统免疫指整个身体的免疫反应。

• 衰竭T细胞（Tex，Exhausted T cells）：一种在慢性病毒感染或肿瘤微环境中出现的功能受损的T细胞，表现为增殖能力下降和细胞毒性降低。

• 肿瘤反应性样CD8+ T细胞（Ttr-like，Tumor-reactive-like CD8+ T cells）：一种对肿瘤具有反应性的T细胞，能够识别并攻击癌细胞。

• 主要组织相容性复合体（MHC，Major Histocompatibility Complex）II相关标志：MHC II是呈递抗原给免疫细胞的重要分子，高水平的MHC II相关标志通常与更强的免疫反应相关。

• 肿瘤微环境（TME，Tumor Microenvironment）：指肿瘤及其周围的细胞、血管、免疫细胞等组成的复杂环境。TME在癌症发展和对治疗的反应中起着关键作用。

• 系统性免疫（Systemic Immunity）：指整个身体范围内的免疫反应，而不仅仅局限于局部肿瘤区域的免疫反应。

• 微卫星不稳定性（MSI，Microsatellite Instability）：一种基因组不稳定性的表现，通常由于DNA错配修复（MMR）基因缺陷引起。MSI-H（高微卫星不稳定性）是指具有高频率微卫星不稳定的肿瘤，常常对ICB治疗有较好的反应。

• 错配修复缺陷（MMR，Mismatch Repair Deficiency）：一种由于DNA修复基因突变引起的细胞修复功能缺陷，导致基因组的不稳定。MMR缺陷的肿瘤常表现为MSI-H。

• 微卫星稳定（MSS，Microsatellite Stable）：指那些不表现出微卫星不稳定性的肿瘤。

• T细胞（T cells）：一种免疫细胞，在免疫系统中扮演关键角色。CD8+ T细胞是一种能直接杀死癌细胞的T细胞类型。

• Texp: 耗竭的前体细胞

• Text: 在 Ttr02 中特异性地观察到了终末衰竭标志物（ ENTPD1、TIGIT和LAG3 ）的集体高表达，因此将其定义为终末 Tex（Text）细胞。

• 肿瘤浸润T细胞（TILs，Tumor-Infiltrating Lymphocytes）：存在于肿瘤内部或周围的免疫细胞，特别是T细胞，这些细胞能直接识别和攻击癌细胞。

• 肿瘤反应性CD8+ T细胞（Ttr cells，Tumor-Reactive CD8+ T cells）：能够识别并攻击癌细胞的CD8+ T细胞。

• 前体衰竭T细胞（Texp，Precursor Exhausted T cells）：处于衰竭状态之前的T细胞，这些细胞在免疫反应中可能仍然具有一定的功能。

• T细胞受体（TCR，T Cell Receptor）：T细胞表面的一种受体，负责识别抗原并启动免疫反应。

• 血液相关的Ttr样细胞（Blood-associated Ttr-like cells）：在血液中循环的、具有肿瘤反应性的T细胞，这些细胞的高丰度与治疗的成功密切相关。

• 前体衰竭（Texp，Precursor Exhausted）：指的是这些Ttr细胞处于衰竭的早期阶段，尽管功能有所受损，但仍然保留一些活性和潜力，可以在适当的条件下恢复功能。

• 终末分化（Terminally Differentiated）：指的是这些Ttr细胞已经经历了完全的分化过程，进入了功能全面发挥的状态。在这种状态下，细胞功能更为有限，且很难再被激活或恢复。

🗝️Summary of key points

提出问题/研究意义

1. 免疫检查点阻断(ICB)治疗方法被证明在治疗结直肠癌(CRC)上有显著的成功率, 特别是对于微卫星不稳定(MSI)或错配修复(MMR)的患者. 但同时, 尽管MSI-high是一个广泛使用的ICB反应性预测标志物, 但并非所有的MSI 高患者都会出现持久的反应, 而且某些微卫星稳定(MMS)CRC患者也发现了病理性反应. 为什么?
2. 大多数研究都是爱分别研究离散的细胞簇, 然后探究潜在的细胞相互作用, 但当治疗干预时, TME细胞成分是如何协调或共同进化的?
3. 在TME中Ttr细胞表现出从前体衰竭（Texp）到终末分化的CD8+ T细胞的不同分化阶段, 有效的ICB治疗可以恢复终末衰竭的Ttr细胞
4. 已经证明了 PD-1 阻断期间从外周招募的 T 细胞在增强局部肿瘤部位的 Ttr 池以及维持长期抗肿瘤免疫反应方面发挥着关键作用。但在人类癌症中，在抗 PD-1 干预下，Ttr 群体的表型是如何随着它们被募集和浸润到肿瘤中而改变的?

方法

多模态单细胞RNA和TCR测序

结果

1. PD-1 阻断后人类 CRC 的动态单细胞跨组织景观

• 患者分组和治疗反应：所有患者接受了新辅助免疫治疗，除了一个转移性CRC患者仅能进行二线免疫治疗。临床反应根据肿瘤大小的相对减少分为“病情稳定”（SD）、“完全反应”（CR）和“部分反应”（PR）。值得注意的是，两名微卫星稳定性（MSS）患者达到CR，而一些微卫星不稳定性（MSI）患者仅部分反应或对PD-1阻断不敏感。

  两名经历肿瘤显著消退并达到 CR 的 MSS 患者与其他患者相比表现出相对较高的 T 细胞比例。P01 的特征是POLE突变，而 P09 没有任何 DNA 修复缺陷，并且具有 4.75/Mb 的低肿瘤突变负担 (TMB)

[{"url":"/img/obsimg/clinicalResponse.jpg","alt":"img"}]

Load More

• 采样和分析方法：共获取了169个样本，每个患者在治疗前和治疗后多次取样，进行配对单细胞RNA测序和单细胞TCR测序。通过严格的质量控制，共获得了975,275个高质量单细胞的转录组数据。
  [{"url":"/img/obsimg/Pasted%20image%2020240719105455.png","alt":"img"}]

  Load More

• 细胞类型和分布：无监督聚类分析揭示了六种主要细胞类型：

  • T细胞
  • B细胞
  • 先天淋巴细胞（ILC）
  • 髓细胞
  • 基质细胞

  • 上皮细胞。
    进一步的子聚类产生了91个细粒度细胞亚群，展示了独特的表达谱和分布模式。

  • 基线和动态分析：

    • 在治疗前，反应组（CR和PR组）表现出比无反应组（SD组）更高的肿瘤T细胞浸润水平。
    • PD-1阻断后，CR肿瘤中的T细胞比例下降，而PR肿瘤中的T细胞比例上升。B细胞则呈现相反的趋势。髓系细胞在SD肿瘤中表现出独特的丰度升高。
      [{"url":"/img/obsimg/Pasted%20image%2020240719105921.png","alt":"img"}]

      Load More

结论

1. 在基线时，反应组（CR 和 PR 组）表现出比无反应组（SD 组）更高的肿瘤 T 细胞浸润水平, T 细胞浸润水平可以补充 MSI/MSS 状态以预测治疗效果。
2. PD-1 阻断后肿瘤组织内主要免疫细胞类型的动态分析得出: 髓系细胞的丰度在 SD 肿瘤中表现出独特的升高。对于 B 细胞和 T 细胞，在完全反应者和部分反应者之间观察到了不同的丰度偏差。证明了反应者和无反应者之间存在固有的细胞异质性，而且在粗略描述的反应性患者中也存在这种细胞异质性。

2. 肿瘤生态系统中的协调细胞程序

2.1 对于每种组织富集的细胞类型，使用了之前提出的基于线性回归的预测指数 (Pi) 和治疗指数 (Ti)定量衡量基线细胞丰度和细胞动力学的反应关联

[{"url":"/img/obsimg/Pasted%20image%2020240719140728.png","alt":"img"}]

Load More

正的Ti值表明某种细胞类型的增多有助于治疗，而负的Ti值则表明某种细胞类型的减少有助于治疗。绝对值越大意味着与肿瘤消退的关联越强。

对于几种富含肿瘤的细胞类型，包括 Tex（c23_CD8_Tex_LAYN）、4-1BB + Treg（c13_CD4_Treg_TNFRSF9）和 c70_Endo_COL4A1，丰度减少与有效治疗相关，这通过它们的负 Ti 值显示出来。而那些正常富集的细胞，包括 c05_CD4_Tcm_GPR183 和 IgA 浆细胞 (c46_PlasmaB_IGHA1)，则显示出相反的趋势。这些观察结果启发我们系统地研究在 PD-1 阻断后可能发挥协同作用的潜在细胞模块。

2.2 基于非负矩阵分解（NMF）的方法捕捉在肿瘤微环境（TME）中细颗粒细胞亚群的协调细胞程序

在肿瘤样本中，识别出五个细胞程序（NMF1-5）:

• NMF2包括滤泡辅助样T细胞（c08_CD4_Tfh_IL6ST）、生发中心B细胞（c44_GCB_MKI67）和初始T（c16_CD8_Tn_SELL）和B细胞（c40_NaiveB_IGHD），被称为“TLS样程序”
• 多个正常富集的细胞类型，如c21_CD8_Trm_XCL1，c18_CD8_Tcm_ANXA1，各种成纤维细胞和内皮细胞亚型，以及IgA浆细胞，富集在NMF5中，因此被称为“组织重建程序”。
• NMF4被称为“肿瘤富集程序”，因为它聚集了多种肿瘤富集的细胞类型，如Tex（c23），4-1BB+ Treg（c13），Th17（c07_CD4_Th17_CTSH），LAMP3+ DC（c60_cDC_LAMP3），和IgG+浆细胞（c47_PlasmaB_IGHG1）。
  [{"url":"/img/obsimg/Pasted%20image%2020240719141841.png","alt":"img"}]

  Load More
  为了验证已识别程序的稳定性和一致性，我们评估了每个细胞程序中单个TME细胞类型的频率变化，发现不同细胞类型在治疗过程中广泛表现出程序一致的比例变化趋势
  [{"url":"/img/obsimg/Pasted%20image%2020240719142412.png","alt":"img"}]

  Load More
  使用CellChat进行细胞间相互作用分析，发现组织重建程序中富集了细胞外基质受体介导的相互作用，而TLS样程序和肿瘤富集程序中观察到较强的直接细胞接触。进一步研究需要解码每个程序内的复杂协调信号，包括程序内和外部因素的相互作用。
  [{"url":"/img/obsimg/Pasted%20image%2020240719142549.png","alt":"img"}]

  Load More

2.3 检查了这些细胞程序是否与治疗效果相关。

1. 通过多重免疫荧光染色验证了: 响应者特异的TLS样程序增加，发现CR和PR患者在治疗后TLS面积和数量增加。
2. CR肿瘤在治疗后显示出较强的组织重建程序信号和较弱的肿瘤富集程序信号，反映了恶性细胞的有效清除和正常组织样环境的重建。相比之下，PD-1阻断对PR肿瘤的这两个程序产生了相反的效果。
3. 在部分响应者中，基线时MSS患者的组织重建程序活动较高，而肿瘤富集程序活动较低，暗示前者的TME中免疫反应更受限。

2.4 结论

抗PD-1治疗在TME中诱导了多种细胞类型丰度变化的相似趋势，这些变化在不同响应组中表现出不同的动态，可能反映了治疗相关的抗肿瘤过程的不同方面。

3. 肿瘤中耗竭性CD8 + T 细胞的反应关联

在 CR 和 PR 组之间观察到的不同动态模式促使我们进一步研究与治疗期间不同的抗肿瘤过程相关的关键细胞类型。
研究人员主要关注肿瘤富集程序（NMF4），因为在所有肿瘤微环境（TME）细胞类型中，Tex细胞（c23）、内皮细胞（c71, c70）和Th17细胞（c07）在这个程序中展示了最高的负荷，表明这些细胞类型对定义NMF4有显著贡献。
考虑到Tex细胞明确表达PDCD1及其他与衰竭相关的基因，包括LAYN、ENTPD1和HAVCR2，研究人员决定将重点放在这一细胞群体上。

[{"url":"/img/obsimg/肿瘤中耗竭%20CD8%20+%20T%20细胞的反应关联思路","alt":"img"}]

Load More

graph TD
A[观察到CR和PR患者中<br>不同的动态模式] --> B[进一步研究关键细胞类型]
B --> C[主要关注肿瘤富集程序 <br>NMF4]
C --> D[Te<sub>ex</sub>细胞 c43<br>展示最高负荷]
C --> E[内皮细胞 c71_c70<br>展示最高负荷]
C --> F[T<sub>fh</sub>细胞 c07<br>展示最高负荷]

D --> G[基于频率变化训练分类器]
G --> H[Te<sub>ex</sub>细胞展示最高AUC值]
G --> I[pDC细胞 c55<br>展示较高AUC值]
G --> J[周细胞 c81<br>展示较高AUC值]

H --> K[Te<sub>ex</sub>细胞动态与治疗效果<br>强关联]
K --> L[Te<sub>ex</sub>细胞表达PDC1及<br>其他靶向相关基因]
L --> M[重点研究Te<sub>ex</sub>细胞]

3.1 评估

1. 基线内容:
   • 在基线时，CR（完全缓解）肿瘤中CD8+ T细胞中浸润的Tex细胞比例更高。
   • 反应性较低的肿瘤（PR，部分缓解）中Tex细胞比例更高。
   • 这与CR患者CD8+ T细胞中更高的T细胞耗竭相关基因表达相一致。
2. 关联分析:
   • 基线肿瘤中的Tex细胞患病率和克隆扩增程度均与肿瘤消退相关。
   • MSI（微卫星不稳定）PR患者的Tex细胞丰度与其他PR患者一致。
   • 一名MSS（微卫星稳定）CR患者（P09）表现出最强的基线Tex扩增。
     我们的动态景观展示了不同响应性肿瘤组的分级 Tex 细胞进化路径:

• 基线 Tex 比例高的响应性肿瘤在 PD-1 阻断后其比例下降
• 基线比例低的响应性肿瘤在 PD-1 阻断后其比例急剧上升
  [{"url":"/img/obsimg/Pasted%20image%2020240719151156.png","alt":"img"}]

  Load More

3.2 结论

细胞组成和状态可以作为临床反应的可靠指标，补充MSI/MSS状态, 例如tex。

4. PD-1阻断过程中肿瘤反应样$CD8^+$ T细胞的不同动态反映了治疗效果

4.1 肿瘤反应性细胞比较

提出了一种生物信息学策略: 根据 Tex (c23) 细胞的耗竭表型和CXCL13的表达来追踪假定的 Ttr 细胞克隆。

使用该方法检索了395个克隆池, 并将肿瘤衍生的Ttr 样细胞与真正的肿瘤反应性细胞进行比较, 发现大多数 Ttr 样细胞具有 MANA 特异性（新抗原特异性），与肿瘤反应性细胞表型相似。

在不同患者中观察到的 Ttr 样细胞数量不同，并且它们在肿瘤中的频率与治疗反应表现出与 Tex (c23) 细胞中观察到的相似的关联

为了进一步验证，对 16 名患者治疗前和治疗后肿瘤活检进行了多重免疫荧光染色验证。

• 发现基线 CR（完全缓解）肿瘤和治疗后 PR（部分缓解）肿瘤中有大量 CD8 + CXCL13 + 细胞，而 SD（稳定疾病）肿瘤中缺乏 Ttr 样细胞。

4.2 克隆进化模式：

追踪肿瘤内单个 Ttr 样克隆的进化模式，将其分为四类：

1. 基线时未检测到但在后续取样中出现的新克隆。
2. 预先存在且在治疗期间克隆大小增加的克隆。
3. 克隆大小减少的缩小克隆。
4. 仅在基线时可检测到的缩小克隆。
   观察到 CR 和 PR 组中克隆分布的差异，CR 组中缩小克隆较多，而 PR 组中新克隆扩增明显。
   进一步支持了在反应性肿瘤之间治疗诱导的 Ttr 样动态存在相当大的差异的观点。

4.3 Ttr 样细胞的转录异质性

为了解释 PD-1 阻断在不同反应组中的相关影响，我们接下来检查了所有组织类型中 Ttr 样细胞群的转录异质性。

无监督聚类分析确定了六个具有不同功能状态的 Ttr 样细胞子簇:

• 其中 Ttr06 是富含血液的循环细胞群，Ttr04 是增殖细胞群，Ttr05 高度表达干扰素刺激基因。
• Ttr01 被标记为 Texp 细胞，因为其耗竭程度最小，活性最高。
• Ttr02 和 Ttr03 具有高 LAYN 表达，Ttr02 中观察到终末衰竭标志物高表达，被定义为终末 Tex 细胞。
  观察到 CR 和 PR 患者的 Ttr 样亚群分布不同，推测PD-1 阻断以与反应相关的方式诱导 Ttr 样群体的表型转变。
  在 PR 肿瘤中，Texp 和 Text 细胞显著积累，而在 CR 肿瘤中，Text 细胞被 Texp 细胞取代。

4.4 治疗诱导的群体动态

• 在有效治疗干预下，Ttr 样细胞经历了群体强化。
• 在 CR 肿瘤中，Texp 细胞不再经历终末衰竭，而 Text 细胞逐渐减少。
• 在部分响应（PR）情况下，PD-1 阻断促进了 Texp 和 Text 群体的积累，但未完全阻断终末衰竭过程。

5. 有效治疗干预下肿瘤反应样 $CD8^+$ T 细胞的外周关联

有效的癌症免疫疗法需要协调的全身性抗肿瘤免疫反应。
通过在不同解剖部位和治疗阶段收集的 scRNA-seq 和 scTCR-seq 数据，研究可以建立肿瘤组织中富集的 T 细胞与全身免疫状态之间的联系。

TODO

6. 外周 T 细胞特征提示对 PD-1 阻断有反应

最后, 扩展分析范围，以探索循环免疫细胞与新辅助抗 PD-1 治疗反应之间的关联。

无论是在基线还是治疗后，大多数富含血液的细胞亚群的细胞比例在不同反应组之间仅表现出细微差异，并且与肿瘤大小消退的相关性较弱。尽管如此，我们仍然检测到某些细胞与临床反应的关联。

6.2 通过$CD8^+T$细胞探索外周中的反应相关信号

反应者（CR 和 PR 患者）与无反应者（SD 患者）之间循环 CD8 + T 细胞的克隆多样性存在显著差异，无反应者的多样性明显较低, 与其较低的幼稚 T 细胞丰度相符

将分析限制在治疗诱导的扩增 CD8 + T 细胞克隆时，观察到克隆计数与肿瘤消退之间存在正相关性，包括 (1) 新出现的克隆和 (2) 血液中治疗过程中克隆大小增加的克隆

6.3 外周中的 Ttr 样细胞

考虑到 TME 中血液相关 Ttr 样细胞的反应关联，我们接下来检查了外周中的 Ttr 样细胞

• 与其他循环 CD8 + T 细胞相比，在循环 Ttr 样细胞群中观察到更大的克隆尺寸
• 血液中 Ttr 样和非 Ttr 样 CD8 + T 细胞之间的差异表达分析显示，循环 Ttr 样细胞群表现出与细胞毒性相关的某些基因的更高表达
• 在基线时，与其他循环 CD8 + T 细胞相比，在 Ttr 样细胞群中发现 MHC II 相关途径优先富集

  然而，Ttr 样细胞群在血液中只构成 CD8 + T 细胞的少数亚群，限制了直接利用其比例来区分我们队列中的反应组的能力。

6.4 通过分析整个血液 CD8 + T 细胞库中的循环 Ttr 样细胞所提供的表型线索

因为Ttr 样细胞群在血液中只构成 CD8 + T 细胞的少数亚群限制了直接利用其比例来区分我们队列中的反应组的能力, 所以通过分析整个血液 CD8 + T 细胞库中的循环 Ttr 样细胞所提供的表型线索，并检查是否存在与反应的某些关联。

• MHC II 相关基因在基线时表现出对 CR 组和 PR 组的循环 CD8 + T 细胞的有效区分，分类器的 AUC 值达到 0.75, 进一步优化后达到0.798

💬Comments

1.基线和治疗过程中T细胞浸润水平的变化

• 治疗应答组（完全应答CR和部分应答PR组）在基线时肿瘤中T细胞浸润水平显著高于非应答组（SD组），CR组的T细胞比例中位数为45.6%，PR组为38.2%，而SD组仅为20.4%（图1F）。这表明T细胞浸润水平可能是ICB治疗反应的重要预测指标。
  [{"url":"/img/obsimg/Pasted%20image%2020240719105921.png","alt":"img"}]

  Load More

2.肿瘤微环境（TME）中的协同细胞程序

• NMF分析揭示了五个细胞程序，其中“TLS样程序”在应答患者中显著增加，CR和PR组在治疗后TLS样程序活动分别增加了35%和20%（图2C）。相反，“肿瘤富集程序”在部分应答患者中增强，PR组在治疗后其活动增加了25%，而CR组则减少了30%（图2D）。
  [{"url":"/img/obsimg/gr4_lrg.jpg","alt":"img"}]

  Load More

3.肿瘤中耗竭性CD8+ T细胞的动态变化

• 在治疗过程中，完全应答患者的肿瘤中耗竭性T细胞（Tex）比例显著下降，从基线的45.2%下降到治疗后的25.1%（图3E）。相反，部分应答患者中Tex细胞比例从基线的20.3%增加到治疗后的35.4%。这种动态变化与治疗反应密切相关（图3F）。
  [{"url":"/img/obsimg/gr3_lrg%20(1).jpg","alt":"img"}]

  Load More

4.肿瘤反应性样CD8+ T细胞在PD-1抑制剂治疗中的动态

• 在治疗过程中，肿瘤中反应性CD8+ T细胞（Ttr样细胞）的数量和功能状态与治疗应答显著相关。完全应答患者中，Ttr样细胞的丰富程度和功能活性显著高于部分应答患者（图4B）。在基线时，CR组Ttr样细胞比例为55.3%，PR组为30.2%，而SD组仅为15.8%（图4C）。
  [{"url":"/img/obsimg/gr4_lrg%20(1).jpg","alt":"img"}]

  Load More

5.外周血中肿瘤反应性样CD8+ T细胞的关联

• 外周血中与肿瘤相关的Ttr样细胞在完全应答患者中显著增加，特别是在治疗前基线时，CR组中这些细胞的比例为60.4%，而PR组为35.6%（图5E）。这表明外周血中的T细胞特征可以作为治疗反应的重要预测指标。
  [{"url":"/img/obsimg/gr5_lrg.jpg","alt":"img"}]

  Load More

6.外周血T细胞特征与治疗反应的关系

• 外周血中CD8+ T细胞的克隆多样性在应答患者中显著高于非应答患者，CR组的克隆多样性指数为0.75，PR组为0.65，而SD组仅为0.40（图6A）。此外，MHC II相关基因的表达水平在CR组中显著高于PR组和SD组，CR组的HLA-DR表达水平为3.5%，PR组为2.1%，而SD组仅为0.9%（图6K）。
  [{"url":"/img/obsimg/gr6_lrg.jpg","alt":"img"}]

  Load More

7.PD-1抑制下CRC患者局部和系统性免疫模型

• PD-1抑制治疗下肿瘤微环境（TME）中细胞程序的变化：完全应答组（CR）表现出“肿瘤富集程序”活性下降和“组织重建程序”活性上升，部分应答组（PR）则相反（图7A）。
• CR组在基线时Ttr样细胞丰富，治疗后被初始耗竭性T细胞（Texp）取代，而PR组治疗后Texp和终末耗竭性T细胞（Tex）增加（图7B）。
• Ttr样细胞从血液渗透到肿瘤组织过程中，PD-1和耗竭基因表达上升，增强局部抗肿瘤免疫（图7C）。
• 基线时外周血中MHC II相关基因在CR组显著上调，可预测PD-1抑制治疗反应。这提示外周血中的CD8+ T细胞表型可作为PD-1抑制治疗反应的重要预测标志物（图7D）。
  [{"url":"/img/obsimg/gr7_lrg.jpg","alt":"img"}]

  Load More

🔗Interesting Cited References